叶面喷施：碳酸氢铵对作物叶片有较强的腐蚀性，容易烧伤叶片，影响光合作用，故不能作叶面喷施的肥料。
干土施用：干土深施覆盖，肥料不能及时溶解被土壤吸咐和供作物吸收利用。只有在土壤具有一定湿度的情况下施用碳酸氢铵，才能及时溶解，减少损失。
高温施用：碳酸氢铵的挥发性和气温高低关系密切，气温越高，挥发激烈，故碳酸氢铵不宜在高温烈日下施用。
与碱性肥料混施：碳酸氢铵若与碱性很强的草木灰、石灰等混合施用或同时施用，会损失肥效，故碳酸氢铵要单施。
与菌肥混用：碳酸氢铵施后会散发出一定浓度的氨气，若与菌肥接触，会使菌肥中的活菌体死亡，失去菌肥的增产效果。
与尿素混施：碳酸氢铵施入土壤后，造成土壤溶液短期呈酸性反应，会加速尿素的挥发损失，故碳酸氢铵不能与尿素混合施用。
与农药混放：碳酸氢铵与农药都是化学物质，极易受潮发生水解反应。有不少农药属碱性，两者混施一起容易产生化学反应，降低肥效和药效。
作种肥施用：碳酸氢铵具有较强的刺激性和腐蚀性，分解时跑出来的氨气和种子接触后，会熏坏种子，甚至烧伤种胚，影响发芽和出苗。
