要从正规合法的农业科研单位和农资经营企业及其委托代理单位购种 《种子法》实施以来，正规合法经营种子的企业有以下几种：一是国家、集体及民营农业科研单位；二是注册资金在１００万元以上，《种子法》实施后按要求领取了《种子经营许可证》、《种子生产许可证》的种子经营企业；三是已合法注册的种子经营企业在其有效区域内的委托代理经营单位；四是按《种子法》规定，已在工商部门注册、经营不再分袋包装的种子企业。
购买棉种要及时索要购种凭证和发票，并保存好种子封样和包装物 少量购种的可只索要购种凭证和发票；集体购种或批量购种时，每个品种至少要抽取４００～５００克种子的封样；要尽量索要正规发票；要签订《农作物种子购销合同》，确定双方责任、权利和义务；要保存好所购种子的包装物。
要选择适合自己种植的品种 在选择品种上既不能一味求新，又不能因循守旧，只认老品种，要根据所在地区土壤情况和种植管理水平合理选择品种。地力差，施肥、浇水条件跟不上的田块，要选择一些中等产量水平的棉花品种，另外也要根据不同的情况，考虑是选择早熟品种还是选择中晚熟品种，是选择适合纯作的小株型品种还是适宜间作套种的大株型品种。
要选择抗病性强的品种 许多老棉区因多年连茬种植，土壤和种子携带病菌，导致棉花枯萎病、黄萎病流行，造成大面积减产甚至绝产。因此，感病棉区和已感病田块再种植棉花时，一定要选择抗病性强的品种。
应尽量购买包衣棉种 种衣剂集杀虫剂、杀菌剂、微量元素于一身，具有抗病、杀虫和增产作用。经包衣的棉种苗齐、苗壮、苗旺，尤其在育苗期间若遇连阴雨天气和低温天气，不易烂种。据试验，种植包衣的棉种可增产１０％～１５％。
购买棉种后一定要在规定的期限检测发芽率并且检验纯度 为了在出现种子质量问题以后，受损害者能够根据《合同法》和《种子法》规定获得赔偿，一般集体和批量购买种子时，要在购种协议上写明双方的责任、权利和义务。需方在购种后，要复验芽率、纯度和水分：芽率应在收获之后两个发牙周期内进行复验；纯度在收获该作物后的一个生产周期内复验完毕。
