根腐病：5～11月发生，6～7月为害严重。开始根系中个别根条或地下茎一部分受害，继而扩展到整个下部。被害部分发生湿烂，外皮变黑色；地上部初时个别茎枝先枯死，严重时整株死亡。防治方法；实行水旱轮作或用生物农药抗120的200倍稀释液灌根；或用50%托布津800倍稀释液喷雾，都有良好的效果。
根腐病：5～11月发生，6～7月为害严重。开始根系中个别根条或地下茎一部分受害，继而扩展到整个下部。被害部分发生湿烂，外皮变黑色；地上部初时个别茎枝先枯死，严重时整株死亡。防治方法；实行水旱轮作或用生物农药抗120的200倍稀释液灌根；或用50%托布津800倍稀释液喷雾，都有良好的效果。
菌核病：5月上旬开始发病，6～7月尤为严重。病菌首先侵害茎基部、芽头及根茎部，使这些部位逐渐腐烂，变成褐色；常在病部表面、附近土面以及茎杆基部的内部，发生灰黑色的鼠粪状菌核和白色的菌丝体。与此同时，病株上部茎叶逐渐发黄，最后植株死亡。防治方法：发病初期用井冈霉素、多菌灵合剂喷雾；也可用50%利克菌1000倍稀释液喷雾或浇注。
叶斑病：是一种细菌性叶部病害。5月初开始发生，可延续到秋末。病株叶片上病斑深褐色，直径1～8毫米，近圆形或不规则形，严重时病斑密布、汇合，叶片枯死。防治方法；①注意开沟排水，降低田间湿度；②剥除茎部发病的老叶，以利通风，减少病源；⑧发病前后喷1：1：150波尔多液。
小地老虎：春季危害幼苗。可用90%敌百虫100克拌入炒香的茶籽饼5公斤作毒饵，撒入田间诱杀。
银纹蛾：5～10月为害，尤以5～6月为害严重。该虫将丹参叶子咬成孔洞或缺刻，严重时叶片被吃光，是丹参的主要虫害。可用90%晶体敌百虫1000稀释倍液，或者25%二二三乳剂250倍稀释液，或25%杀虫脒水剂300～350倍稀释液喷雾。
灯蛾：9月下旬发生，幼虫食害丹参叶片。可用90%晶体敌百虫1000倍稀释液喷雾。
