新棚建造时，为方便操作，多是将地表层的熟土用挖掘机挖起后，用于堆砌棚墙，而用来种植蔬菜的土壤多是距离地表1.5米左右的生土，这样的土壤有机质缺乏，因此要大量补充有机肥。
一是增加鸡粪等粪肥的施用量。新建棚室多是生土，有机质缺乏，因此要大量补充有机肥，像稻壳粪、鸡粪等有机肥，可以将亩用量提高到35方左右。这些有机肥施用后，虽不能迅速增加土壤中的有机质，但却可以在一定程度上改善土壤的理化性状。
二是增施生物菌肥。新建的大棚，土壤中的各种微生物含量较少，即使将大量的鸡粪、稻壳粪等有机肥施用到大棚土壤中，也因为土壤中缺乏微生物，不能快速地将有机肥分解转化成土壤有机质。因此，菜农在新建大棚土壤中施用稻壳粪、鸡粪等有机肥时，一定要注意增施生物菌肥，以快速补充土壤中的微生物。
三是增施商品有机肥。商品有机肥的有机质含量高，使用后有助于土壤快速地补充有机质。菜农可以在第一次向新建大棚土壤中施用粪肥后，结合施用商品有机肥，每亩施用500公斤左右，这样可保证蔬菜生长前期所需的营养。
四是注意补充氮、磷、钾肥。新建大棚土壤都是生土，土壤中的氮、磷、钾含量极低，所以在施用基肥时一定要注意增施氮、磷、钾肥料。菜农可以增加氮、磷、钾肥的用量。一般来说，每亩用化肥100斤左右。
